BTN101104 3′RACE試劑盒

產品簡介
3′RACE試劑盒是高品質的基因結構和功能產品,由北京百奧萊博供應,本產品僅用于生物化學研究方面,本產品質量好,且具價格,深為用戶稱道,了解更多3′RACE試劑盒等基因結構和功能產品請聯系我司咨詢訂購。...
產品詳細介紹
特別提示:包括3′RACE試劑盒在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:3′RACE試劑盒
英文名稱:3′-RACE Kit
產品貨號:BTN101104
產品規格:10次
研究真核基因的zuì基礎的工作之一就是確定其轉錄終止位點,目前zuì通用的方法是3′-RACE法,RACE(Rapid Amplification of cDNA Ends)是Frohman發明的、通過PCR快速克隆cDNA末端的技術,它在不建立cDNA文庫的前提下,利用已知cDNA序列設計引物,通過往兩端延伸和擴增獲得其3′-端序列。本試劑盒就是根據3′-RACE原理而開發。RACE的原理如下圖:

產品特點:
1. 即開即用,客戶不需要單獨準備各種材料。
2.反應條件經過精心優化,包括使用無RNase H活性的MMLV和優化的引物。
試劑盒組成:
| 成分 | 規格 |
| MMLV逆轉錄酶-RI混合物(RNase H-,200U/μL) | 10μl |
| MMLV Buffer(含dNTP) | 50μl |
| PCR MagicMix 2.0(含酶和染料) | 1.5ml |
| 3′-RACE引物A(10μM) | 10μl |
| 3′-RACE引物B(10μM) | 100μl |
| 3′-RACE引物C(10μM) | 100μl |
| RNase-Free水 | 1ml |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:低溫運輸、-20℃保存、有效期一年。
使用方法:
一、利用含Oligo(dT)的3′-RACE引物A進行逆轉錄
注意:MMLV酶使用前必須短暫離心,因為它含50%甘油,及其粘稠,否則將取不到所需體積。
1.在一個PCR管中,加入以下組分:
| 成分 | 用量 |
| Poly(A)RNA(或總RNA) | 0.2-2μg(5μg) |
| 3′-RACE引物A(10μM) | 1μL |
| MMLV Buffer(含dNTP溶液) | 5μL |
| RNase-Free水 | 補至19μL |
| 合計 | 19μL |
注意:如果可能,zuì好使用Poly(A)RNA作為模板。
65℃保溫5分鐘,展開RNA的二級結構,立即冰浴待用。
2. 再在上述PCR管中加入1μl MMLV逆轉錄酶-RI混合物(200U/μL)。
3. 37℃保溫60分鐘,42℃保溫30分鐘進行逆轉錄反應;然后50℃保溫10分鐘終止反應。
4. 加入0.5mL RNase-free水稀釋上步得到的cDNA,冰浴待用。長期放置需要放-20℃保存。
二、利用基因專一性引物A和3′RACE引物B進行輪PCR
5. 用不同量的RT反應液(稀釋后的cDNA)設置PCR(樣品組zuì好設置用量梯度,單位:μL)。
| 成分 | 梯度1 | 梯度2 | 梯度3 | 梯度4 |
| 稀釋后的cDNA | 1 | 5 | 10 | 15 |
| 基因專一性引物A(10μM) | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 2.5 |
| 3′RACE引物B(10μM) | 2.5 | 2.5 | 2.5 | 2.5 |
| 98℃ 5分變性RNA-cDNA雜交鏈,短暫離心后再加入下列成分 | ||||
| PCR MagicMix 2.0 | 25 | 25 | 25 | 25 |
| RNase-free水 | 19 | 15 | 10 | 5 |
| 合計 | 50 | 50 | 50 | 50 |
6. 按下列條件進行PCR(注:應根據實際情況選擇適當的退火溫度)。
第1次循環:52-60℃ 2分,72℃ 40分(此步的目地是合成第二鏈的cDNA,復性溫度需要根據自備基因專一性引物A的Tm值進行優化,一般可以從55℃開始)。
第2-30次循環:94℃ 1分鐘,52-60℃ 1分,72℃ 3分(此步為PCR擴增,復性溫度需要根據自備基因專一性引物A的Tm值進行優化,一般可以從55℃開始)。
zuì后延伸:72℃ 15分
7. 取5μl的PCR反應液進行瓊脂糖凝膠電泳以確認PCR擴增產物。若得到目的擴增產物需要用于后續實驗,請于-20℃保存;若沒有得到目的擴增產物,可按下列步驟進行巢式PCR反應。
三、利用基因專一性引物B和3′RACE引物C進行巢式PCR反應
8. 將上輪PCR產物(4管)均用水稀釋稀釋20倍,然后每管均用巢式PCR進行擴增。巢式PCR反應設置如下:
| 成分 | 用量 |
| PCR MagicMix 2.0 | 25μl |
| 上步得到的PCR反應液(稀釋20倍后) | 1μl |
| 基因專一性引物B(10μm) | 2.5μl |
| 3′RACE引物C(10μm) | 2.5μl |
| 超純水 | 補至50μL |
9. PCR反應。按下列條件進行PCR:
第1-30次循環:94℃ 1分鐘,52-60℃ 1分,72℃ 3分(復性溫度需要根據自備基因專一性引物B的Tm值進行優化,一般可以從55℃開始)zuì后延伸:72℃ 15分
10.電泳檢測。然后根據實驗結果進行DNA測序或TA克隆。
注意事項:
1. 如果兩輪PCR得到的非特異產物多,可以在RT反應是繼續降低3′-RACE引物A的用量。
2.自備的基因專一性引物的GC含量zuì好跟3′-RACE引物B和引物C的一致,后者長度均為18nt,均含11個G(或C),7個A(或T)。
根據您的關注的3′RACE試劑盒,您可能還對以下產品有需求:
名稱:Acetylcholinesterase/ACHE mRNA原位雜交試劑盒
貨號:ZN0013
規格:100T
基本信息:
保存條件:4℃保存一年
工作量:100張切片。
有效期:一年。
適用種屬:human,rat,mouse,rabbit
標記方式:3’—尾段標記
標記方式:3’—尾段標記
試劑盒中內容:
1.胃蛋白酶(×10; Pepsin)2ml;
2.預雜交液 2ml;
3.Acetylcholinesterase/ACHE mRNA原位雜交試劑盒寡核苷酸探針雜交液 2ml;
4.封閉液 5ml;
5.生物素化鼠抗地gāo辛 5ml;
6.SABC-POD 5ml;
7.生物素化過氧化物酶 5ml。
用戶自備試劑:
原位雜交專用蓋玻片;POLY-L-LYSINE;DEPC;20%甘油
緩沖液(3%檸檬酸,2×SSC,0.5×SSC,0.2×SSC,原位雜交用 PBS)
一.培養細胞和冰凍切片
準備工作:
固定液:4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6);1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6)
3%檸檬酸——100ml蒸餾水中加檸檬酸(C6H8O7?H2O)3g,PH2.0左右。
2×SSC——1000ml蒸餾水中加氯化鈉17.6g,檸檬酸三鈉(C6H5O7Na3?2H2O,分子量294)8.8g。
0.5×SSC——300ml蒸餾水加100ml 2×SSC即可。
0.2×SSC——270ml蒸餾水加30ml 2×SSC即可。
20%甘油——20ml甘油加80ml蒸餾水即可。
原位雜交用PBS(1000ml蒸餾水加氯化鈉30g,Na2HPO4?12H2O 6g,NaH2PO4?2H2O 0.4g),PH7.2-7.6。
操作程序:
注意:zuì重要的是及時固定,并在固定液中加入0.1%的DEPC處理,以抑制RNA酶對mRNA的分解作用。此外,過度固定對原位雜交有明顯的不利影響。
1.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。切片厚度10-20μm。
2.細胞在多聚賴氨酸處理的蓋玻片上進行培養,條件為37℃和5%的CO2,所用培養基為Dulbecco基礎培養基。細胞長好后0.1M PBS(PH7.4)洗2分鐘×3次。
3.培養細胞和冰凍切片均可用下述方法固定:固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 20--30分鐘。蒸餾水充分洗滌,干燥后-20℃冰凍可保存2周以上。
4.30%H2O2 1份+純甲醇50份混合,室溫處理30分鐘。蒸餾水洗滌3次。
5.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化5—120秒鐘。有時也可以不消化。原位雜交用 PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。
6.后固定:胃蛋白酶消化后才需要。固定液為1%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.2-7.6),含有1/1000 DEPC。室溫固定 10分鐘。蒸餾水洗滌3次。
7.預雜交:濕盒的準備——干的雜交盒底部加20%甘油20ml以保持濕度。按每張切片20μι加預雜交液。恒溫箱38-42℃2—4小時。吸取多余液體,不洗。
8.雜交——按每張切片20μι雜交液,加在切片上。將原位雜交專用蓋玻片的保護膜揭開后,蓋在切片上。恒溫箱38-42℃雜交過夜(根據雜交情況可以調節)。
9.雜交后洗滌:揭掉蓋玻片,37℃左右水溫的2×SSC洗滌5分鐘×2次;37℃0.5×SSC洗滌15分鐘×1次; 37℃0.2×SSC洗滌15分鐘×1次(如果有非特異性染色,重復0.2×SSC洗滌15分鐘×1-2次)。
10.滴加封閉液:37℃30分鐘。甩去多余液體,不洗
11.滴加生物素化鼠抗地gāo辛:37℃ 60分鐘或室溫120分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
12.滴加SABC:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×3次。勿用其它緩沖液和蒸餾水洗滌。
13.滴加生物素化過氧化物酶:37℃20分鐘或室溫30分鐘。原位雜交用PBS洗5分鐘×4次。
14.DAB顯色:使用DAB顯色試劑盒—1ml蒸餾水加顯色劑A,B,C各一滴,混勻,加至標本上。一般顯色20-30分鐘。若無背景出現則可繼續顯色。也可自配DAB顯色劑后顯色。充分水洗。
15.必要時蘇木素復染,充分水洗。
16.酒精脫水,二甲苯透明,封片。
二.石蠟切片
如果有條件的話,應盡可能地采用新鮮標本。標本離體后,及時予以固定。固定液為4%多聚甲醛/0.1 M PBS(PH7.0-7.6),含有1/1000 DEPC。標本較大時用刀片切成厚度不超過4mm的小塊,固定1小時即可,較大的標本固定不要超過2小時。某些組織對過度固定尤其敏感,如動物大腦,固定時間30-40分鐘,一般不要超過1小時。
1.常規脫水、浸蠟、包埋。切片厚度6-8μm。
2.玻片的處理:一般采用多聚賴氨酸或APES。
3.石蠟切片經常規脫蠟至水。30%H2O2 1份+蒸餾水10份混合,室溫5-10分鐘以滅活內源性酶。蒸餾水洗3次。
4.暴露mRNA核酸片段:切片上滴加3%檸檬酸新鮮稀釋的胃蛋白酶(1ml 3% 檸檬酸加2滴濃縮型胃蛋白酶,混勻),37℃或室溫消化3--30分鐘(視標本新舊、厚薄自行調整)。用戶可以比較不同的消化時間,例如5分鐘,10分鐘,20分鐘,30分鐘。以找到zuì佳的消化時間。原位雜交用PBS洗3次×5分鐘。蒸餾水洗1次。其余步驟和冰凍切片6-16步相同。
結果觀察:
Acetylcholinesterase/ACHE的細胞胞漿著色呈棕黃色。
注意事項:
由于特定的mRNA序列僅占總mRNA的少數,加上基因僅由四個堿基排列組合而成,因此原位雜交容易出現非特異性染色。通過不加探針和用陰性標本做對照,基本可以確定染色是否為特異性的。有明顯的非特異性染色現象時,用預雜交液對含探針的雜交液進行稀釋,一般稀釋2—10倍;并應加強探針雜交后的洗滌。如果有少量的細胞核著色屬于正常情況;如果出現大量的細胞核著色,往往和標本固定時間過長有關,應重新處理標本。

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