BTN90603C 隨機引物法DNA探針地高xīn標記試

產品簡介
北京百奧萊博供應的隨機引物法DNA探針地高xīn標記試用于科研試驗,本產品質量好,且具價格,深為用戶稱道,了解更多隨機引物法DNA探針地高xīn標記試等探針標記及檢測產品請聯系我司咨詢訂購。...
產品詳細介紹
特別提示:包括隨機引物法DNA探針dì高辛標記試劑盒在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:隨機引物法DNA探針dì高辛標記試劑盒
英文名稱:Random Primer DNA Labeling Kit(Digoxin)
產品貨號:BTN90603C
產品規格:5次
本試劑盒是基于Feinberg和Vogelstein發明的隨機引物標記法而開發出來的即用型DNA探針標記試劑盒,標記過程由雙鏈DNA熱變性、隨機引物與單鏈DNA結合、在Klenow DNA聚合酶催化下,引物的延伸合成DNA探針并摻入標記的核苷酸三步組成,可用下面的示意圖表示:

本產品對Feinberg和Vogelstein經典方法進行了改良。
產品特點:
1. 提供的標記反應液整合了除酶和模板外的所有成分,簡化了反應加樣步驟,提高了標記反應的可重復性。
2. 使用無外切活性的Klenow exo- DNA聚合酶,已標記DNA探針不會被酶降解。
3.快速,zuì快1小時即可完成標記反應。
4. 得到的DNA探針比活性高(如果是同位素,可以達到109cpm/μg DNA),檢測靈敏度高。
5. 所需模版DNA量少(只需要10ng以上即可),DNA可以是各種形狀(線狀和環狀)的、也可以是單鏈或雙鏈的,長度在100bp以上均可。
6. 得到的探針長度在200-400nt之間,可以用于Southern雜交、Northern雜交、原位雜交、菌落和斑點印跡雜交等。
7. 提供三種標記選擇,其中BTN90603A可用于各種同位素標記和其他任何非同位素標記,但需自備標記底物;BTN90603B和BTN90603C可分別用于生物素和dì高辛標記,不需自備標記底物。
試劑盒組成:
| 成分 | 規格 |
| 2×A型標記反應液(自備標記物型) | 50μl(僅A型有) |
| 2×B型標記反應液(生物素型) | 50μl(僅B型有) |
| 2×C型標記反應液(DIG型) | 50μl(僅C型有) |
| dATP,2mM | 10μL(僅A型有) |
| dTTP,2mM | 10μL(僅A型有) |
| dGTP,2mM | 10μL(僅A型有) |
| dCTP,2mM | 10μL(僅A型有) |
| Klenow exo-聚合酶(2U/μL) | 5μl |
| 超純水 | 1ml |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
1.在一干凈的硅化的塑料離心管中加入下列成分:
| 成分 | 用量 |
| 模板DNA | 50-150ng |
| 2×標記反應液(ABC三種之一) | 10μl |
| 超純水 | 補水到15μl |
注意:非同位素標記物由于疏水性強,容易與常用的塑料離心管表面非特異性結合,所以一定要使用硅化的塑料離心管。模板DNA并非越多越好,因為模板會在雜交反應中跟標記的探針雜交,競爭性地抑制探針跟靶分子的雜交。
2. 沸水浴5-10分鐘,或在PCR儀上100℃加熱5-10分鐘使DNA模版充分變性,立即放冰上待用。注意:如果PCR儀器不能設置到100℃,99℃加熱5分鐘也可。
3.高速離心數秒使所有液體集中在管底,根據試劑盒類型加入下列成份:
| 試劑盒類型 | 成分及用量 |
| BTN90603A型 |
dATP、dGTP、dCTP各1μl(共3μL,濃度均為2mM) 自備的2mM dTTP/標記dUTP混合物(見注)1μL 1μl Klenow exo聚合酶 |
| BTN90603B型 |
1μl Klenow exo聚合酶 4μl超純水 |
| BTN90603C型 |
1μl Klenow exo聚合酶 4μl超純水 |
注:上表中的dTTP/標記dUTP混合物中dTTP和標記的dUTP的總濃度為2mM(在20μL體系中混合液的終濃度為0.1mM,dTTP與生物素或DIG標記的dUTP的比例zuì好為65:35)。由于空間阻礙,并非標記生物素或DIG標記的dUTP越多靈敏度越高,一般dTTP與標記dUTP的比例在65:35為zuì佳。但如果使用自備的其他標記核苷酸,如fluorescein、hydroxycoumarin、resorufin和aminoallyl標記的dUTP,則用戶需要自己摸索其與dTTP之間的zuì佳比例,如果使用32P標記的dUTP,則比活zuì好為3000Ci/mmol,濃度為好為10uCi/μL,并且不需要加入dTTP。
4. 輕柔吹打混勻。如有液滴沾在管壁上,高速離心數秒使所有液體集中在管底。
5. 37℃保溫1-20小時。標記效率跟模版量和保溫時間相關,具體見下表:
| 模版DNA用量 | 1小時后探針合成量 | 20小時后探針合成量 |
| 10ng | 80ng | 900ng |
| 30ng | 150ng | 1.35μg |
| 100ng | 350ng | 1.65μg |
| 300ng | 750ng | 2.2μg |
| 1μg | 1.3μg | 2.6μg |
| 3μg | 1.6μng | 2.6μg |
6. 加1μl自備的0.5M EDTA(pH8.0)終止反應,立即放冰上待用或放-20℃保存一年。用前需要加熱100℃ 5分鐘使DNA探針變性成單鏈,然后直接加入到雜交反應液中即可。如果電泳檢測,標記產物將是彌散狀態。
注意:本方法標記核苷酸摻入率高,因此可以不經純化直接使用。如果需要純化,注意不要用酚抽提法純化非同位素(生物素、DIG和其他等)標記的DNA探針,因為這些標記分子疏水性強,能使標記的DNA進入疏水的有機相而丟失,但可以用乙醇沉淀和Sephadex G50回收(可另購非同位素探針柱式純化試劑盒)。對比活高的同位素探針,由于其其不穩定,因此應該立即使用,不要長久放置。
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名稱:5′末端同位素標記試劑盒
貨號:BTN131036
規格:20次
本產品為DNA 5′末端標記系統,利用T4 Polynucleotide Kinase(T4多聚核苷酸激酶)和[γ-32P]ATP 對粘性末端或平末端的DNA或RNA的5′末端進行標記反應。原理如下:

產品特點:
1. 使用本試劑盒之前,不需要對 5′末端的磷酸基團進行去磷酸化處理,因為使用的kinase 能使5′末端的磷酸與[γ-32P]ATP的γ-磷酸進行交換。
2. 合成的單鏈或雙寡核苷酸的5′末端游離的OH基團都能通過Kinase反應被標記(或者只是簡單的磷酸化)。
3. 提供的兩種反應液使交換反應和磷酸化反應都能進行,均能得到大于106 cpm/pmol(5′-end)的比活性。
試劑盒組份:
| 成分 | 規格 |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 20μl |
| 5×交換反應緩沖液 | 100μl |
| 10×磷酸緩沖液 | 50μl |
|
Co | 20μl |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:低溫運輸,-20℃保存,有效期一年。
使用方法:
一、交換反應
1. 實驗前需自備的試劑:7 M 醋酸銨、乙醇、70%乙醇等
2.在微量離心管中制備下列反應液:
| 成分 | 加入的體積 |
| 自備的5′磷酸化DNA片段 | 14μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 5×交換反應緩沖液 | 5μL |
| [γ-32P]ATP | 5μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 滅菌的超純水 | 補足到25μL |
注:5 pmoles的5′末端約等于0.17μg的長100bp的雙鏈DNA。
3. 37℃反應30分鐘。
4. 70℃加熱5~10分鐘使酶失活。
5. 加入10μl的7 M CH3COONH4(pH4.5)。如使用CH3COONa做乙醇沉淀時使其終濃度達300mM。
6. 加入87.5μl(2.5倍)的冷無水乙醇,-20℃放置30~60分鐘。
7.離心回收沉淀,用 70%的冷乙醇清洗沉淀,真空干燥。
8. 用適當 Buffer 溶解沉淀。
注:通過第5~8 步操作幾乎可以除去大部分未反應的[γ-32P] ATP,如要完全將其除去時,乙醇沉淀后用凝膠過濾等方法精制即可。如需用苯酚抽提除去蛋白質時,請在第8 步之后進行。
二、磷酸化反應標記
A. 去磷酸化反應
1. 實驗前需自備的試劑:TE 飽和酚/lǜ仿、3 M NaCl 、乙醇、70%乙醇、牛小腸堿性磷酸酶(CIAP)等
2.在微量離心管中制備下列反應液:
| 成分 | 加入的體積 |
| 自備的DNA片段 | 133μL(≤10μg) |
| 1M Tris-HCl,pH8.0 | 15μL |
| 牛小腸堿性磷酸酶(CIAP,10~20U/μL) | 2μl |
| 滅菌的超純水 | 補足到150μL |
3. 50℃反應30分鐘。
4. 加入150μl的TE 飽和酚/lǜ仿/異戊醇(25:24:1),充分混勻。
5.離心,取上層(水層)移到另一個微量離心管中。
6. 重復操作 4~5。
7. 加入7.5μl的3 M NaCl(zuì終濃度150mM)。
8. 加入375μl(2.5倍量)的冷無水乙醇,-20℃放置30~60分鐘。
9.離心回收沉淀,用 1mL 70%的冷乙醇清洗后,沉淀真空干燥。
10. 使用 20μl的TE Buffer 溶解沉淀。
B. 磷酸化反應(前反應)
1.在微量離心管中制備下列反應液:
| 成分 | 加入的體積 |
| 自備的DNA片段 | 20.5μL(≤5 pmoles的5′末端) |
| 10×磷酸緩沖液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 滅菌的超純水 | 補足到25μL |
2. 37℃反應30分鐘。
3.下面的操作與交換反應的第4-8 步操作相同。
三、合成DNA 寡核苷酸的標記
1.在微量離心管中制備下列反應液:
| 成分 | 加入的體積 |
|
Oligo | ≤3μL |
| 10×磷酸緩沖液 | 2.5μL |
| [γ-32P]ATP | 1μL |
| T4 多聚核苷酸激酶(10U/μL) | 1μL |
| 滅菌的超純水 | 補足到25μL |
2. 37℃反應30分鐘。
3.下面的操作與交換反應的第4-8 步操作相同。
四、合成DNA 寡核苷酸的標記
當摻入水平很低的時候,需要使用本步驟,即通過體積排阻色譜或過濾試劑盒除去未反應的標記。Sephadex G-50 層析柱(需另購)對于去除未摻入的dNTPs效果很好,它還能大幅減少小于20個堿基的DNA 寡核苷酸和小于20bp的雙鏈DNA的量。使用之前需要在70℃加熱5~10分鐘以使T4 多聚核苷酸激酶失活。Sephadex G-25 層析柱可以用來純化長度不小于10個堿基的寡核苷酸。
注意事項:
1.緩沖液可在室溫融解。融解后立即置于冰中,使用前充分混勻。
2. 5×交換反應緩沖液于-20℃凍結保存時會有白色渾濁出現,但不影響反應效果。
3.酶切得到的DNA片段需經乙醇沉淀等方法純化。
4. 當用于交換反應的DNA在5 pmoles以上(約1,000bp以上)時,標記效率有時會低于106 cpm/pmol。
5. 如果交換反應所用 DNA低于500bp時,標記效率有時會有所降低。
6. 若不進行放射線標記,僅使用本試劑盒做5′末端磷酸化反應時,反應體系中的[γ-32P]ATP可用5μl的10mM ATP 代替。
7. 磷酸化反應時的[γ-32P]ATP可用[γ-35S]ATP 替代。
使用舉例:
按照使用方法中交換反應和合成DNA 寡核苷酸的標記的實驗操作,取λ-BstP I,λ-Hpa I,λ-EcoT22 I 各3 pmols,用[γ-32 P]ATP 通過正向磷酸化反應或交換反應標記。各DNA片段的放射自顯影結果如下所示:

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