BTN70606 一站式miRNA尿素-PAGE電

產品簡介
一站式miRNA尿素-PAGE電泳套裝由北京百奧萊博供貨并提供相關技術服務支持,本品僅用于生物化學研究方面,我公司專注于核酸電泳和回收產品的研發、生產和供應,為您提供的一站式miRNA尿素-PAGE電泳套裝質量可靠,批間差小,且價格公道,熱切盼望您選購我們的產品。...
產品詳細介紹
特別提示:包括一站式miRNA尿素-PAGE電泳套裝在內,本公司的所有產品僅可用于科研實驗,嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途!
產品名稱:一站式miRNA尿素-PAGE電泳套裝
英文名稱:One-Stop miRNA Urea-PAGE Pack
產品貨號:BTN70606
產品規格:30次
尿素-聚丙烯酰胺凝膠電泳(Urea PAGE)是目前分離200nt以下的小片段RNA,尤其是20nt左右的microRNA(miRNA)分子的主要方法,但是單獨配制各種溶液十分繁瑣,為此我們公司開發了本產品。
產品特點:
1.一站式,含有電泳所需要的所有試劑,即開即用,十分方便,免去了實驗人員稱取有毒物品。
2. 靈活,可以根據需要配制各種濃度的Urea-PAGE,以便對長度各異的RNA進行電泳。
3.電泳后可直接用于UV觀察、銀染、膠回收、Northern雜交和放射自顯影等。
4. 使用緩沖液,可以防止甘油的干擾。
產品組成:
| 成分 | 規格 |
| 尿素 | 210g |
| 丙烯酰胺 | 60g |
| 甲叉雙丙烯酰胺 | 3g |
| TBE電泳液,10× | 250ml |
| TEMED | 1.5ml |
| 過硫酸銨(干粉) | 1g |
| miRNAload | 10ml |
| miRNA Marker | 30次 |
| 固相RNase清除劑 | 100ml |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸、4℃保存(miRNAload、miRNA Marker需要-20℃保存)。保存期為一年。
使用方法:
一、準備工作
1. 用固相RNase清除劑清潔工作的臺面和器皿(詳見該產品的使用手冊)。
2. 配制1 X電泳緩沖液:將適量的10X電泳緩沖液用RNase-free水稀釋10倍,得到1X電泳緩沖液待用。
3. 配制10%過硫酸銨溶液:稱取約100mg過硫酸銨到一干凈的1.5mL離心管中,按每1mg過硫酸銨加10μl RNase-free水的比例加入RNase-free水,搖晃致溶,立即使用。注意:放置時間不要超過一周。
二、配制凝膠
1. 估計所需要的凝膠溶液的體積,一般配制一塊13cm×15cm×0.8mm的膠需要15mL凝膠溶液,配制一塊36cm×45cm×0.8 mm的膠需要120mL凝膠溶液。
2. 根據所需要的凝膠溶液的體積,在一的干凈的三角瓶中按下表加入各成分(此處以配制100mL濃度為15%的凝膠為例):
| 成分 | 終濃度 | 用量 |
| 尿素 | 7M | 42g |
| 40% Acrylamide/Bis溶液 | 15% | 37.5mL |
| 10×電泳緩沖液 | 1× | 10ml |
| 補RNase-free水到100mL | ||
注:Acrylamide/Bis的終濃度需要根據待分離RNA長度選擇(見下表)。
| 需分離的RNA長度范圍 | Acrylamide/Bis工作濃度 |
| 6-100nt | 20% |
| 25-150nt | 15% |
| 40-200nt | 12% |
| 60-400nt | 8% |
| 80-500nt | 5% |
| 1000-2000nt | 3.5% |
3. 攪拌并加熱到40-50℃左右,直到尿素完全溶解。
4. 冷卻到室溫后,將三角瓶接上真空系統抽真空處理10-15分鐘以充分去除溶液中的氧氣(氧氣會降低聚合反應效率)。但如果實驗條件有限,此步也可以省略。
5. 邊搖晃溶液變加入50μl TEMED和500μl 10%過硫酸銨。注意:即使選擇其他工作濃度的Acrylamide/Bis,TEMED和10%過硫酸銨的用量也不需要隨之改變。但如果配置的凝膠溶液的體積變化,TEMED和10%過硫酸銨的用量也要按比例改變。
6. 再充分搖晃約30秒后迅速灌膠,然后插入樣品梳。
7.室溫放置30-60分鐘使膠凝固。
8. 將凝膠板放置在電泳裝置上后,在上下層分別加入適當量的1×電泳緩沖液。如果不馬上使用,需要有濕紙將上樣孔端蓋住以防凝膠過度干燥。
9. 拔出梳子后用加樣槍吸取電泳緩沖液,充分將每個加樣空中未聚合的Acrylamide/Bis、尿素和氣泡吹打出來。
三、電泳
1.在上樣前,預電泳 20-30分鐘以使多余的過硫酸銨跑出加樣空,同時還可以使凝膠的溫度升高(到 50℃左右),有利于RNA電泳時維持在變性狀態。預電泳電流見下面第 5 條。
2. 將miRNA樣品與等體積的miRNAload 混合,70℃保溫 2-3分鐘后迅速放置在冰上冷卻,快速離心半分鐘,放冰上待用。
3. 關電泳儀后開始上樣。注意:每次上樣后如果不更換槍頭,則需要充分吹打洗凈槍頭以防樣品的交叉污染。
4. 同時上樣 miRNA Marker。
5. 重開電泳儀,對 13cm×15 cm的膠,以20-30mA的電流電泳,直到紅色染料移動到凝膠邊緣為止;對 36cm×45cm的膠,則以50-60mA的電流電泳,直到紅色染料移動到凝膠邊緣為止。
四、后續處理
1.染色觀察:將凝膠一面的玻璃板揭開,直接用仍然附著在另一玻璃板上的凝膠進行各種染色,包括銀染(固定、漂洗、顯影和定影等步驟)、EB(每100mL 1×TBE中加 20μL 10mg/mL的EB溶液)、我們公司低毒核酸染料 DNAgreen(每100mL 1×TBE中加10μL DNAgreen 原液)。UV下觀察并拍照。
2. miRNA回收:按上法用EB等染料染色后,UV下確定所需要的miRNA條帶的位置,切膠后進行膠回收處理。
3. Northern雜交:按上法用EB等染料染色后,UV下確定所需要的miRNA條帶的位置,切膠后電轉移到帶正電的尼龍膜上,然后進行雜交處理。
4. 放射自顯影:如果miRNA樣品電泳前經過同位素標記,則將凝膠一面的玻璃板揭開,用濾紙將附著在另一玻璃板上的凝膠吸附過來,然后包上保鮮膜,真空抽干,然后使膠跟X光片向對置進行放射自顯影。
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名稱:一站式DNA非變性PAGE電泳套裝
貨號:BTN100205
規格:30次
本品就是專門用于非變性PAGE的試劑。非變性PAGE電泳是研究SSCP-PCR(single-strand co
產品特點:
1.一站式,用戶只需要準備水和樣品,十分方便。
2. 安全,免去了實驗人員接觸粉末狀的劇毒物品丙烯酰胺。
3. 靈活,高濃度的丙烯酰胺溶液可用于配制各種濃度的PAGE膠,分開提供的丙烯酰胺和甲叉雙丙烯酰胺可用于配制各種交聯度的PAGE膠。
4. PAGE電泳后可直接用于銀染等后續試驗。
產品組成:
| 成分 | 規格 | 保存 |
| 丙烯酰胺 | 60g | 室溫 |
| 甲叉雙丙烯酰胺 | 2g | 室溫 |
| TEMED | 1.5ml | 4℃,避光 |
| 過硫酸銨(干粉) | 1g | 室溫 |
| 非變性PAGE上樣液,2× | 1ml | 4℃ |
| 10×TBE(BTN90313) | 250ml | 室溫 |
| 說明書 | 1份 |
儲存條件:常溫運輸,保存條件見上表,有效期一年。
使用方法:
用于SSCP-PCR分析的非變性PAGE電泳(其他應用請相應修改參數)
一、PAGE濃度的選擇:zuì好使用濃度為5-12%的丙烯酰胺膠,因為SSCP-PCR的擴增長度一般在150-200bp之間,而5%的PAGE的有效分辨范圍為80-500bp、8%的PAGE的有效分辨范圍為60-400bp、12%的PAGE的有效分辨范圍為40-200bp。
二、PAGE交聯度的選擇:交聯度越低,孔徑越大,對DNA分子構象的變化越靈敏,SSCP分辨率越高,但過低則膠太軟,不好進行電泳后的后續操作,所以一般選擇1-2%的交聯度(即丙烯酰胺:甲叉雙丙烯酰胺在49:1到48:2之間)。
三、體積的選擇:SSCP-PCR檢測需要長約30-40cm的測序膠板,可以結合梳子的厚度,計算膠的體積。
操作:
1. 配制PAGE膠(這是配制100mL膠的用量,配制更大體積的膠則需以此用量為基礎按比例增加)
A:新鮮配制10%的APS(過硫酸銨):按每0.1克過硫酸銨干粉加1mL超純水的比例將水加到裝有硫酸銨干粉的1.5mL EP管中,搖晃到粉末全部溶解。配制好的10%的APS溶液可以在4℃存放一周。
B:新鮮配制適當交聯度29:1的30%的丙烯酰胺-甲叉雙丙烯酰胺溶液(AB溶液,下同):在本產品提供的裝有60 g丙烯酰胺干粉的塑料瓶中加入146mL自備的去離子水和全部的甲叉雙丙烯酰胺,充分搖晃直到溶解(約需10-20分鐘),即得到30%的AB(29:1)溶液。此溶液zuì好在一個月內用完,必須4℃避光保存。
C:配SSCP PAGE膠:在一個250mL的三角瓶中,先按下表的用量加入去離子水、30% AB溶液溶液和10×TBE緩沖液。丙烯酰胺單體溶液具有神經毒性,一定要戴手套操作。
| PAGE膠濃度 | 各成分用量(單位:ml) | 總體積(ml) | ||
| 去離子水 | 30%AB溶液 | 10×TBE緩沖液 | ||
| 5% | 73.4 | 16.6 | 10.0 | 100 |
| 6% | 70.0 | 20.0 | 10.0 | 100 |
| 7% | 66.7 | 23.3 | 10.0 | 100 |
| 8% | 63.3 | 26.7 | 10.0 | 100 |
| 9% | 60.0 | 30.0 | 10.0 | 100 |
| 10% | 56.7 | 33.3 | 10.0 | 100 |
| 11% | 53.3 | 36.7 | 10.0 | 100 |
| 12% | 50.0 | 40.0 | 10.0 | 100 |
注:有大量文獻報道PAGE膠中加入5%-10%的甘油能提高某些位點的分辨率。如果選擇加入10%的甘油,則減少去離子水的用量10mL,同時加入10mL甘油。
D:搖晃混勻。zuì好能抽真空10-15分鐘以去除溶液中的氧氣(氧氣能抑制丙烯酰胺聚合反應),無條件也可以不脫氧。
E:加入500μL 10%APS和100μL TEMED,迅速搖勻后倒膠。
F:在膠的液面距離達到頂部時停止灌膠,插入梳子。
G:室溫聚合30-60分鐘(低溫抑制聚合反應)。
H: 拔出梳子,用1×TEB液沖洗加樣孔。
I: 放4℃冰箱預冷30分鐘-12小時。為了防止膠收縮,zuì好頂部加少量1×TBE緩沖液。預冷的膠有利于保持單鏈DNA的構型。
2. 將預冷的凝膠板固定在電泳裝置上,往上槽和下槽中加入足夠1×TEB電泳液。
3. 取3-5μl SSCP-PCR樣品,加入等體積2×非變性PAGE上樣液,85℃處理5分鐘后冰浴。用前短暫離心后取2μl上樣。
4.連接電源線,打開電源開關。如果PAGE中不含甘油,則使用25W的功率,電泳5-7小時(對3—40cm長的PAGE膠而言)。如果使用含甘油的PAGE,則使用8W的功率,電泳16-18小時。由于溫度變化過大會改變DNA構型,所以電泳時zuì好能保持恒溫。對不含甘油的PAGE,zuì好恒溫在4℃、對含甘油的PAGE,zuì好恒溫在25℃。
5. 終止電泳,取出凝膠進行后續的處理(如銀染)。
疑難解答:
一、為何SSCP-PCR帶型有復合條帶?
原因之一:可能是殘留的PCR引物跟單鏈的DNA結合形成遷移率不同的條帶。解決方法是稀釋PCR或電泳前將PCR產物進行純化。
原因之二:可能是PCR產物用量過高,彼此復性。解決辦法是將PCR產物稀釋后4-8倍后使用。
二、如何提高電泳分辨率?
可以在配膠時加入甘油(終濃度為5%-10%),因為甘油是弱變性劑,能部分展開DNA折疊結構,增加表面積,增加電泳時位移差異。但加入甘油后粘性變大,電泳速度變慢,因此只適合室溫電泳使用,不要4℃電泳。如果條件允許,zuì好同時做加甘油和不加甘油的電泳實驗。

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